依山坡而建的芝热寺又称止热寺,坐落在冈仁波齐神山的北面,海拔5085米,与之隔河向望。芝热寺的建筑风格具有藏传佛教特色,其金顶在远处显得格外醒目,是朝圣者转山路线上的一个重要补给点和落脚点。传说中,郭仓巴(或称果仓巴)在此修行时曾看到一头牦牛为他引路,这头牦牛引领郭仓巴到达了一块显眼的磬石旁后便突然消失不见。郭仓巴随后在一处洞顶的巨石上发现了牦牛角清晰的印记,后来就将此洞作为自己的修行静室,称此洞为芝热普(牦牛隐没洞迹)。此后,竹巴噶举派的众多大师、高僧在此洞内修行。后来,竹巴噶举派的大师鼎秦顿珠彤美以此洞为中心修建了芝热寺。
从寺庙主建筑底部,穿过两尊石狮子之间的台阶上行,经过大门进入寺内,继续前行并登上几级台阶,便抵达了著名的“母牦牛角洞”。洞口旁的墙壁上绘有精美的壁画,中央是狮面空行母的画像,周围则分别是胜乐金刚、金刚亥母、莲花生大师、马尔巴和米拉日巴等重要人物的形象。洞内顶部巨石上的长长痕迹就是母牦牛角印,而旁边则是郭仓巴的帽子所留下的印迹。
相传,郭仓巴在“母牦牛角洞”修行时,狮面空行母曾从附近山上采集“萨夏”(一种天然生成、富含营养的白色泥土,亦称“地味”)作为食物供养给他,并在寺庙下方的一块石头留下了脚印。这个脚印位于寺庙宾馆旧址后方,沿着通往寺庙的石阶左侧,藏于围墙内一个类似佛龛的凹陷处。由于后来修建的围墙遮挡,位置比较隐蔽,因此现在很少人知道。
芝热寺已有700多年历史,20世纪六、七十年代被毁坏,于1986年开始重建。
1996年,丁增南江仁波切应邀从青海玉树来到芝热寺主持寺庙至今。
2016年,芝热寺再次重修扩建完成后,成为了冈仁波齐周边五座寺庙中规模最大的,现属于噶玛噶举派。