花莲小沙丁鱼分布于西太平洋区之台湾东部海域,或向南至香港海域。
花莲小沙丁鱼鳃盖光滑;下枝鳃耙数51-66。体被细薄圆鳞,极易脱落;鳞片上之垂直条纹可能不在中央部位中断,或上下部份在中央部作重叠;背鳍和臀鳍基部有发达之鳞鞘;胸鳍和腹鳍基部具腋鳞。背鳍位于体中部前方,具软条17-19;臀鳍位于体之后半部,具软条19-20;腹鳍软条8;尾鳍深叉。
花莲小沙丁鱼体背部青绿色,体侧下方和腹部银白色;鳃盖末缘具不明显黑斑。背鳍淡黄,前端基部具黑点;尾鳍淡黄,上下叶或具黑缘,且末端具大块黑斑;胸鳍淡黄;余鳍淡色。
花莲小沙丁鱼沿近海中上层洄游性中小型鱼类,群游性,以浮游生物,如矽藻、桡脚类及其它小型无脊椎动物为主要食物。