清光绪二十五年(1899年)5月18日,清政府分别向英国、德国银团借款980万英镑;于清光绪三十四年(1908年)开始动工兴建津浦铁路;清宣统三年(1911年)筑成;民国元年(1912年)黄河大铁桥建成后,津浦铁路全线通车。
民国三年(1914年),浦口火车站和其附属建筑于竣工交付使用,浦口火车站成为连接河北、山东、安徽、江苏等11省的交通枢纽。
1968年,南京长江大桥通车,浦口火车站的客运暂时停止。
1985年5月,浦口火车站再次恢复客运。
2004年10月,浦口火车站客运正式停止运营。
浦口火车站,为老式英式建筑,三层砖木结构,米黄色外墙,红色大屋顶。伸出直通月台的单柱伞形长廊和连接轮渡码头的拱形雨廊,连接着一座3层米黄色的主楼,红色的屋顶上写着“南京北站”四个大字,主楼正对面的广场上还有一座专门为纪念孙中山先生灵柩停放处所建的“中山停灵台”。
浦口火车站的特点就在于候车大楼、月台、雨廊、售票房、贵宾楼、高级职工宿舍等主体及配套建筑,都被系统性地保存下来,堪称完整的“百年车站”。房屋顶是青灰色的机平瓦,外立面是土黄色的水泥砂浆粉刷,具有类似“小二楼别墅”的形制。浦口火车站建筑中的月台、雨廊等附属建筑,采用了钢筋混凝土的结构。
浦口火车站在经历了日军侵华的炮火和“文革”中的特大火灾后,主体建筑基本保留,其中,站房楼内木结构的楼梯楼板更换了三分之二,现有三分之一保留了昔日的面貌。主楼的候车厅大门关闭,窗户被墨绿色木板封死。浦口火车站遗存文物主要包括主体大楼、中山停灵台、贵宾楼、电报房等四处,其余设施还包括:电厂、高级职工住宅楼、火车轮渡桥、机车仓库等。
民国七年(1918年)冬,朱自清去北京上学,在浦口火车站与父亲话别,写下《背影》。
民国八年(1919年),孙中山在《建设》杂志上发表《实业计划》一文,认为交通运输必须放在近代工业首位,把浦口火车站列入建设重点。
民国九年(1919年)春,毛泽东送湖南留法学生去上海,在浦口火车站丢失了一双布鞋,陷入困顿,幸遇老乡,解了燃眉之急(斯诺《西行漫记》)。
民国十九年(1929年)5月28日,装运孙中山先生的灵柩的火车通过津浦铁路从北平运抵浦口火车站,在这里稍作停靠后通过浦口码头过江,最后安葬于中山陵。
民国三十八年(1949年),邓小平和陈毅由合肥到达浦口火车站,当夜过江,驱车进驻总统府,迎来南京解放的曙光。
2004年,南京市文物局对浦口火车站旧址进行环境整治。
2006年,浦口火车站旧址被列为江苏省文物保护单位,明确保护对象的有:主体大楼、中山停灵台、贵宾楼、电报房等四处。其余设施还包括:电厂、高级职工住宅楼、火车轮渡桥、机车仓库等。
2013年5月3日,浦口火车站旧址被列入第七批全国重点文物保护单位名单。
2013年10月,南京市政府在此列碑介绍了这座南京重要近现代建筑风貌区。
根据2015年7月《现代快报》报道,浦口火车站旧址的主楼和售票处会被打造成火车文化展览馆,游客可以进去参观,外立面也将改为青砖色。
2017年3月19日,浦口火车站旧址开始动工改造。