海南三亚珊瑚礁国家级自然保护区是1990年9月经国务院批准建立的国家级海洋类型自然保护区之一,位于海南省三亚市南部近岸及海岛四周海域,地理位置为东经109°20′50″~109°40′30″,北纬18°10′30″~18°15′30″范围内。中接壤神奇的鹿回头半岛和著名的大、小东海沿岸海域(包括小洲岛);西濒传奇美丽的东、西瑁岛四周海域。保护区自东向西由亚龙湾片区、鹿回头半岛--榆林角片区和东、西瑁岛片区三部分组成,保护总面积85平方公里。各片区分有核心区、缓冲区和实验区。本区地貌中部与东、西部有明显差异,东、西部属典型的海岛地貌;中部岬角、海湾多,属半岛陆域地貌。保护区海域与三亚市几处主要著名旅游海湾--亚龙湾、大东海海湾、三亚湾及天涯海角相邻,丰富和构成了三亚滨海景区的生态内涵。
本保护区主要保护对象为:造礁珊瑚、非造礁珊瑚、珊瑚礁及其生态系统和生物多样性。造礁珊瑚的建造者为珊瑚虫,珊瑚虫属热带海洋腔肠动物。区内珊瑚种类繁多,目前为止,已查明有117种(包括5个亚种)造礁珊瑚,分别属于13科、33属和2亚属。还有在成礁建造中有积极意义的苍珊瑚、笙珊瑚、多孔螅和多种非造礁珊瑚--软珊瑚、柳珊瑚和与珊瑚礁生态系统共栖和密切依赖的其他丰富多样的海洋生物。
本保护区主管部门是国家海洋局、海南省海洋与渔业厅,三亚国家珊瑚礁自然保护区管理处负责本保护区的保护、建设与管理。管理处下设三个珊瑚礁保护站,并设有一处供公众生态教育的珊瑚标本展览馆及配有一批执法管理、宣教、科研设施及装备。