拥有用肉眼看见“菌”能力的少年泽木直保和青梅竹马结城萤进入农业大学所发生一连串的趣事,透过直保和其他人物的互动可以了解许多跟菌相关的知识,也因为直保的特殊能力而招惹许多事情,这次的动画中完全再现了原作里登场的100种以上细菌,一气呵成的热闹的细菌军团"酿"活动集结了CG技术的优势,描绘了非常壮烈的视觉效果。2D,3D,写实等特效,在每集动画中的片尾都有“菌剧场”,本作清新可爱,搞笑的同时也轻松的介绍了很多科普知识,各种“菌”不仅造型超萌,而且有自己的思想,还可以说话,有的口气还十分狂妄:“小心我酿了你!”。
泽木惣右卫门直保(沢木 惣右卫门 直保(さわき そうえもん ただやす) )
声优:阪口大助
主人翁,农大农学部一年级生,种曲店(又称做豆芽店)的次子,拥有看见“菌”的能力。能与空气中的“菌”进行对话外,也可以徒手抓住空气中的“菌”。
结城萤(结城 蛍(ゆうき けい) )
直保的青梅竹马好友,农大农学部一年级生,是酿酒场老板的儿子,和火落菌
(食果糖乳杆菌、Lactobacillus fructivorans)有着深仇大恨。
川滨拓马(川浜 拓马(かわはま たくま))
声优:杉山纪彰
农大农学部二年级生,和美里同寝,对虫有详细研究。
美里薰(美里 薫(みさと かおる))
声优:小西克幸
农大农学部二年级生,住在学校宿舍内,喜欢喝酒。
长谷川遥(长谷川 遥(はせがわ はるか))
声优:大原沙耶香
树庆藏老师的研究生,能力很强同时家里还非常有钱,个性也非常现实,给人一种高高在上难以相处的感觉,不过和直保他们相处下来已经慢慢开始改变。
树庆藏(树 庆蔵(いつき けいぞう))
声优:西村知道
农大的农学部教授,和直保的爷爷是旧识,受托照顾直保。
及川叶月(及川 叶月(おいかわ はづき))
声优:神田朱未
农大农学部一年级生,专长除菌,洁癖非常的严重会随手携带清洁用品。
武藤葵(武藤 葵(むとう あおい))
声优:能登麻美子
农大农学部三年级生,也是树研究室唯一的讨论发表会生,外形亮丽深受农大男生们的欢迎但却曾遇上爱情骗子。