南京市职工大学成立于1958年，由南京市总工会举办。学校是经江苏省人民政府批准，国家教育部备案的独立设置的成人高等学校，是目前南京市为数不多的具有招收成人脱产高等学历教育学生的成人高校之一。

1958年，在南京市地方工业干部学校的基础上，成立了南京市业余工业大学，后经江苏省人民政府批准，并报国家教育部审定备案，是国内最早建立的成人高等学校之一。文革”开始后，学校被迫停办。1977年9月，中共南京市委同意南京市总工会筹备恢复南京市业余工业大学，并于1979年12月批复复校。1980年2月恢复招生。

其后，南京市政府分别于1980年10月、1981年6月两次报请江苏省政府审批南京市工业大学。1981年11月，江苏省人民政府批准举办，1982年11月国家教育部批准备案。

1994年经江苏省人民政府批准，更名为南京市职工大学。

80年代以来，学校连续多次被中华全国总工会、江苏省总工会、南京市委、市政府以及南京市总工会评先进单位，并被国家教育部和中华全国总工会分别授予“全国成人高等教育先进学校”和“全国先进职工大学”称号。

目前，学校实行“学历 技能”的教学模式，在教学中把以学历为目标的理论教学和以就业为目标的技能培训相结合，鼓励学生在毕业时能取得“一书多证”。

建校近60年来，在本校接受过各类教育的各行业人员累计达40余万人次，学校为南京的发展、建设和教育普及做出了不懈的努力。学校各校区均位于主城区内，交通便利。学校拥有物理、电子、机械、计算机、会计模拟等实验室及电教室、多媒体教室、多媒体语音室、图书阅览室等。学校还建有学生宿舍、学生食堂等配套设施。学校是南京市职业教育联合会的主要成员，学校目前已与南京市近百家企事业单位建立了紧密的实习就业合作关系。在实现教育资源整合、实现校企优势互补等方面发挥了重要作用。