1992年-1997年,在北京大学进行本科阶段学习。
1997年,被保送攻读北京大学人工生命专业硕士研究生,后又继续在北大攻读博士学位。
1999年,我国开始承担1%的人类基因测定,在人类基因组计划中承担中国部分的数据分析工作。
2001年,在中国籼稻基因组计划中负责生物信息学分析部分。
2002年,获得北京大学生命科学学院理学博士学位。
2003年,作为"非典型性肺炎"早期诊断的主要参与者之一,在短时间内完成了四株与“SARS”密切相关的冠状病毒基因组解码工作。同时进行“非典型性肺炎”早期诊断的科研攻关,以最快速度将30万份“免疫检测试剂盒”免费送到防治SARS的第一线。
2004年,晋升为研究员。
2007年6月-2008年11月,带领团队在深圳完成第一个黄种人的基因组研究项目——“炎黄一号”。
2009年-2012年,带领科研团队完成国际大熊猫基因组计划、黄瓜基因组计划和桑蚕基因组重测序计划等一系列项目,同时提出人类“泛基因组”的概念,对格陵兰约四千年前的古爱斯基摩人基因组进行测序,并联合欧盟开展“人体肠道元基因组研究计划(MetaHIT)”的研究、组织实施中国人糖尿病和肠道微生物研究计划等。
2012年,带队组织实施“百万多组学计划”、“代谢性疾病与其他数量性状组学水平研究计划”、“单基因及个体水平肿瘤研究计划”“东亚人群的基因组多态性研究”、“千种单基因病基因组计划”“肠道微生物研究计划”“以及多个多态性图谱和分子育种计划(包括水稻、蚕和猪基因组)等项目。
2013年,带领团队成功收购美国上市公司:Complete Genomics。
2015年7月17日,辞去华大基因研究院院长、华大基因CEO职务。
2015年10月27日,在深圳创建“碳云智能科技有限公司”。
2002年,荣获中国科学院“重大创新贡献奖”。
2002年,荣获复旦大学“谈家桢基金生命科学九源奖学金一等奖”。
2002年,荣获北京大学“学术十杰”称号。
2002年,荣获香港求是科技基金会“杰出科技成就集体奖”。
2003年,荣获北京大学“东盛科学论文奖”。
2002年,荣获“中央国家机关优秀青年”称号。
2003年,荣获中国科学院“杰出科技成就奖”。
2008年,荣获第十届中国国际高新技术成果交易会“百名风云人物”称号。
2008年,荣获广东省“五一劳动奖章”。
2009年,荣获“赛默飞世尔特约之2008年度生命科学十大风云人物”称号。
2009年,荣获“广东省劳动模范”。
2010年,荣获“全国劳动模范”称号。
2011年,荣获“2011年深圳市技术发明奖”。
2011年,荣获第十二届中国青年科技奖”。
2011年,荣获第十三届“广东青年五四奖章”。
2010年,荣获“2010年深圳市自然科学奖”。
2012年,荣获《自然》杂志“2012年科学界年度十大人物”称号。
2012年,荣获“2012年度广东省科学技术奖自然科学类二等奖”。
2012年,荣获深圳市盐田区“杰出人才奖”。
2013年,荣获复旦大学“谈家桢生命科学创新奖”。
2013年,荣获“深圳市科学技术奖之市长奖”。
2013年,荣获科学中国人“科学中国人2012年度人物”称号。
2013年,被汤森路透社评为“最热门科学人物之一”。
2013年,荣获“2012年度中国糖尿病十大最具影响力研究奖”。
2013年,荣获中国科协“周光召科技奖”。
2013年,荣获科学研究领域“影响世界华人大奖”。
2019年10月10日,以90亿元人民币财富位列《2019年胡润百富榜》第444名。
2020年2月26日,以100亿元人民币财富名列《2020世茂深港国际中心·胡润全球富豪榜》第2000位。